鳳鼻頭文化層 距今約 3,500~2,400 年前，為本遺址最晚期的文化層。出現貝塚、紅褐色素面夾砂陶為主要特色，並有彩陶、黑陶和磨光黑陶。器型有罐形器、缽型器、筒型器、盆形器等，並有陶紡輪。石器有石斧、石鋤、石錛、石刀、石鏃、網墜、玦、石環等，並有骨尖器。

從出土遺物特色中，鳳鼻頭文化可進一步細分成兩個時期，早期階段陶器以夾砂灰陶為優勢，地層中有少量大型貝類，年代距今 3,400~2,900 年前；晚期則以夾砂紅陶為優勢，貝類除數量增加許多，種類類別也增加許多，但體型上有小型化的情形，年代約距今 2,900~2,400 年前。

整個鳳鼻頭文化，生業型態上表現出對農業可能有較大的依賴。聚落型態與前期大致相當，呈現長期定居的狀態，未有明顯擴張。從器物的組成，農耕生產的石器較多樣來看，除了根莖作物的種植外，可能有種植稻米，但從陶器數量增加的結果來看，可能反應人口密度增加，也表現出生業型態增加了採集貝類的要素。