大正3年(1914)8月以內地人包國榮興為首等89位蕃薯藔街內臺人士，籌組「有限責任蕃薯藔信用組合」，10月6日獲得臺灣總督府核可，正式成立，這就是今日旗山農會的起源，首任組合長包國榮興。
旗山信用利用組合在吳見草的帶領下，除了維持既有的信貸事業外，逐年擴大經營項目，如：自耕農擔保貸款、協助零細農業經營者的長期低利貸款，兼營肥料統銷和香蕉容器製造等。並於昭和17年(1942)興建碾米工廠，這對於農村經濟發展有正面的幫助。昭和18年(1943)12月，臺灣總督府頒佈「農業會令」，隔年2月旗山信用利用組合解散，後被旗山街農業會併為旗山農業會信用部，此為旗山農會開始具有金融功能之濫觴。
戰後，農會的接收改組歷經一段混亂期，民國42年(1953)才塵埃落定而成為旗山農會。隨著旗山香蕉日益蓬勃，旗山農會業務也優異發展，辦公空間漸形擁擠，民國48年(1959)9月15日進行三樓辦公室增建工程，而成為今日建築樣貌。
整體建築物立足於二條要道交口，為順應街道走勢，臨街切45度為入口；正面立二方柱，柱身洗石子打格，其上有一簡單山牆，左右兩翼樓下開方窗，二、三樓則立柱設廊道，臺度及柱為洗石子，其餘側面貼淺色面磚裝飾，是旗山街區古老建築的地標。
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